蛋白质结构与功能
本次讲座将围绕蛋白质(酶)的结构与功能展开,介绍酶催化反应机制及蛋白质翻译后修饰对酶活性与特异性的影响。
报告介绍
报告共分为四讲。前两讲为研究蛋白质(酶)的重要背景知识。第一讲将讨论展示蛋白质在生物学和人类健康中重要性的教科书级蛋白质结构与功能实例。
第二讲将探讨酶动力学数据的分析方法以及酶催化效率的测定方式。第三讲将通过QM/MM计算方法演示酶可能在催化反应中具有保持反应活性构象的能力,这一机制据目前所知尚未被先前研究充分认识。第四讲将讨论预先存在的组蛋白翻译后修饰(PTMs)如何影响组蛋白修饰酶的活性与特异性,并探索调控其相互作用的一般机制。
我们将介绍最近提出的假设:PTM诱导的底物辅助激活可能是实现PTM写入和控制PTM串扰的潜在内在机制之一。
报告人介绍
郭鸿教授在吉林大学师从唐傲庆先生研究密度矩阵理论,获硕士学位。在哈佛大学师从诺贝尔奖得主Martin Karplus教授,获博士学位。
在哈佛学习期间,郭鸿采用从头算量子化学方法研究了蛋白质肽键的氢键作用,揭示出肽键的氢键相互作用具有高度的协同性,并在结构和能量方面产生一些重要影响;他和Martin Karplus提出有必要对大多数模拟中使用的经典力场进行修正,可用随外部扰动变化(例如:电荷极化效应)而调整内部参数的力场。
其后加入加拿大院士Dennis Salahub教授的研究组,将以上氢键的极化效应推广到酶催化反应。1998年返回哈佛大学参与Martin Karplus教授及诺贝尔奖得主William Lipscomb的工作,揭示出与诱导契合模型不同,酶可能在催化反应中诱导底物发生构象变化,使底物结构沿反应坐标向过渡态方向改变,从而起到催化作用。
2002年他进入美国田纳西大学,2013年获该校终身正教授。郭鸿教授长期专注于QM/MM分子动力学模拟,研究生物大分子体系中的催化反应机制,解释酶催化及底物/产物特异性的基本原理。
近年来,郭鸿等人提出了一种新的酶催化反应机制,即酶具有保持反应构象的能力,在反应过程中防止其过早发生构象扭曲成为低活性形式;还提出,由PTM(蛋白质翻译后修饰)诱导的底物辅助激活 (Substrate-Assisted Stimulation) 是实现PTM写入及调控PTM交互作用的潜在内在机制之一。
